修士課程は、コースワークに加え、専門性の高い研究活動が中心となります。学期ごとに研究の進捗を発表する機会が与えられ、指導教員以外からコメントを受けることができます。この機会を都市工学専攻では「ジュリー」と呼んでいます。

特に優秀な修士論文には「都市工学専攻優秀修士論文賞」が授与されます。また、工学系研究科の中でも優れたものについては、「工学系研究科長賞」が授与されます。