大学院においては修士課程、博士後期課程ともに研究活動が中心となりますが、主に修士課程の学生向けに高度に専門的な講義群も提供されています。これら講義群はほぼすべて英語でも提供されており、留学生が日本人と同様に学ぶことができる環境が整えられています。逆に日本人は必然的に国際的な環境で学ぶことになります。また、修士課程では毎学期、博士後期課程では毎年度ごとに研究の進捗を「ジュリー」と呼ばれる発表会で発表することで、他研究室の教員から評価と研究指導を受けることができます。このほか、大学院では実際の都市に入って行うプロジェクトにかかわったり、専門分野についての勉強会や輪講を行うなど、様々な活動が行われています。
大学院S1S2タームの標準的な時間割（2023年度）
| Mon | Tue | Wed | Thu | Fri | |
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| 1 | |||||
| 2 | Environmental Risk Management [S1] Appropriate Technology for Environmental Sanitation II E [S2] 都市防災特論 [S1S2] |
都市設計特論第二 [S1S2] | 都市居住特論 [S1S2] | 都市交通計画特論第三 [S1S2] | Advanced Lecture in Landscape Planning [S1S2] |
| 3 | Urban Redesign Studio [S1S2] | Advanced Course in Residential Environment [S1] Urban Water Systems [S1S2] |
Advanced Water Quality Engineering [S1] | 環境工学実験演習特論 [S1] | 環境工学実験演習特論 [S1] |
| 4 | Forefronts of Urban Environmental Projects [S1] Global Urban Planning [S1S2] |
Systems and Tools toward a Sound Materal-cycle Society [S2] | |||
| 5 | |||||
| 6 | Urban Redesign Study [S1S2] |
大学院A1A2タームの標準的な時間割（2023年度）
| Mon | Tue | Wed | Thu | Fri | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | |||||
| 2 | 都市計画特論第二 [A1A2] | 広域計画特論 [A1A2] | Advanced Course in Urban Transport Policy [A1] Advanced Course in Urban Transport Planning and Analysis [A2] |
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| 3 | Environmental Systems Analysis [A1] Environmental Reaction Kinetics [A2] |
Advanced Course in Environmental Microbiology [A1A2] 空間計画理論 [A1A2] |
Hazardous Waste Management [A2] | ||
| 4 | Advanced Course in Health-related Water Microbiology [A1] Fundamentals of Water Pollution Control [A2] |
Regional Planning [A1] Urban Development Policy and Planning [A2] |
Management of Global and Urban Environment [A1A2] | ||
| 5 | Studio Work in Urban Development [A1A2] | ||||
| 6 | Urban Studies in the Post-Pandemic Era [A1] |